Faberlic-partner.ru

Faberlic-partner.ru - фатоватый ресурс

Метки: Сцепление генов локализованных в одной хромосоме, сцепление матиз 0.8.

Неравновесное cцепление генов (англ. linkage disequilibrium) — неслучайное распределение частот аллелей разных локусов, которое может быть обусловлено не только тесным генетическим сцеплением генов, но и наличием адаптивного преимущества конкретной комбинации аллелей, частота которой соответственно возрастает в сравнении с частотой, ожидаемой при случайном распределении.

Программы для вычисления LD

  • LiAn - Linkage Analysis 3.5 (sIa) (online)
  • Arlequin 3.11 (p-values, D, D', r², χ²) (Windows)
  • LinkDos on the Web (Δ, D, D') (online)
  • MultiLocus 1.3b (Ia, rd) (Windows, MacOS)
  • LDA - Linkage Disequilibrium Analyzer 1.0 (D', r², χ²) (Java, Windows, MacOS)
  • MIDAS - Multiallelic Interallelic Disequilibrium Analysis Software 1.0 (Python, Windows, Linux)

Визуализация

  • JLIN - Java based Linkage Disequilibrium plotter 1.6.0 (Java)
  • GOLD - Graphical Overview of Linkage Disequilibrium (Windows)

Ссылки

  • Mueller J.C. Linkage disequilibrium for different scales and applications. Brief Bioinform. 2004, 5:355-364.
  • A Compilation of Some Available Software for Linkage Disequilibrium Analysis


Tags: Сцепление генов локализованных в одной хромосоме, сцепление матиз 0.8.